В этом замечательном фантастическом боевике люди создали искусственный интеллект, а он развился и поработил все человечество, поселив его в виртуальной реальности, точь в точь копирующей нашу современную жизнь, где люди работают, женятся, растят детей... В ней жил мистер Андерсон (Ривз), работающий программистом в фирме, все свободное время отдающий поискам чего-то, о чем он смутно догадывается, в компьютерных сетях, в которых он известен под именем Нео. Агенты охраны системы искусственного интеллекта тоже почуяли, что Нео к лишним знаниям подбирается, и решили прибрать его к рукам - сделать своим информатором. В этом момент на связь к нему вышел Морфиус (Фишберн), живущий в настоящем, реальном мире, в полуразрушенных трущобах, оставшихся на месте бывшей цивилизации. Он рассказал Нео, что люди пытались воевать с восставшими механизмами, закрыли небо облаками, чтобы те не могли пользоваться солнечными батареями. Но тогда механическая цивилизация стала использовать людей вместо батареек. Лежат себе люди вплоть до грудных детей в инкубаторах, а снится им, что они живут. Согласно предсказанию, Морфиус сможет найти избранного, того, кто один сможет расправиться с агентами и искусственным интеллектом. Избранный - Нео. Морфиус, конечно, не один борется против системы, есть у него верные помощники. Один, правда, оказался предателем. Есть и красивая девушка Тринити (Троица, по-русски), которая полюбила Нео. Ее любовь спасет ему в нужный момент жизнь...

Во второй части трилогии, борцы за свободу Нео, Тринити и Морфеус продолжают вести восстание людей против Армии Машин. Для уничтожения системы репрессий и эксплуатации они вынуждены прибегнуть не только к арсеналу превосходного оружия, но и к своим экстраординарным навыкам. Участие в миссии по спасению человеческой расы от её полного исчезновения приносит им более глубокое понимание конструкции Матрицы и осознание центральной роли Нео в судьбе человечества. Не обойдётся в фильме и без Агента Смитта, который предстанет перед нами в усовершенствованной версии.

Пока Армия Машин пытается уничтожить Зион, его жители из последних сил держат оборону. А единственной надежде человечества, избранному Нео, предстоит исполнить свою миссию, его ждет путешествие туда, куда не ступала нога человека - в самое сердце Города Машин, и решающая схватка с главным врагом - Агентом Смитом, созданным Матрицей и уже не контролируемымы ею. Считанные часы остаются до того момента, когда Зион падет и спасение людей будет невозможным...